Masjid Baiturahman
Masjid Baiturahman menjadi pusat kegiatan keagamaan di madrasah, digunakan untuk pelaksanaan ibadah serta berbagai kegiatan pembinaan spiritual siswa.
Bidang Sarana dan Prasarana
Bidang sarana dan prasarana bertanggung jawab dalam pengelolaan, pemeliharaan, serta pengembangan fasilitas yang menunjang kegiatan belajar mengajar.
Masjid Baiturahman menjadi pusat kegiatan keagamaan di madrasah, digunakan untuk pelaksanaan ibadah serta berbagai kegiatan pembinaan spiritual siswa.
Laboratorium IPA digunakan sebagai sarana praktik untuk menunjang pembelajaran sains, sehingga siswa dapat memahami materi melalui kegiatan eksperimen secara langsung.
Halaman madrasah dimanfaatkan sebagai ruang terbuka untuk kegiatan upacara, olahraga, serta berbagai aktivitas siswa lainnya dalam lingkungan yang nyaman.
Gerbang madrasah merupakan akses utama untuk masuk ke lingkungan MTs Negeri 3 Bogor. Melalui gerbang madrasah ini warga madrasah melintas keluar masuk untuk melaksanakan kegiatan belajar mengajar dan proses pendidikan.
Pos Satpam menjadi tempat penjagaan sekaligus menjaga keamanan dan ketertiban madrasah.